A SBPJor promove congressos nacionais anuais desde 2003, sempre no mês de novembro. O primeiro encontro foi sediado pela Universidade de Brasília, seguido pela Universidade Federal da Bahia (2004), Universidade Federal de Santa Catarina (2005), Universidade Federal do Rio Grande do Sul (2006), Universidade Federal de Sergipe (2007) e Universidade Metodista de São Paulo (2008). Em 2009, o Encontro Nacional de Pesquisadores em Jornalismo acontece na Universidade de São Paulo.

A associação também já organizou dois congressos internacionais: o V Congreso Iberoamericano de Periodismo en Internet (2004) e a I Journalism Brazil Conference (2006).

Os encontros recebem apoio do CNPq e da Capes, bem como de agências de fomento estaduais, empresas – como Petrobras, Santander e Caixa Econômica Federal – e entidades parceiras. O número de trabalhos apresentados cresce a cada ano, passando de 60 artigos em 2003 para 152 artigos em 2008. Todos os textos são publicados em CD-Rom, na íntegra, e podem ser acessados também neste portal, basta navegar pela nossa  Sala de Pesquisa.